הריבית על משכנתא לרכישת נדל"ן מסחרי גבוהה יותר ביחס למשכנתא רגילה לדירה, כיוון שדירה נחשבת על פי הבנקים לנכס בטוח יותר ביחס לנכס מסחרי, וכידוע גובה הריבית נגזר גם על פי הסיכון שהבנק לוקח, אך כמובן שהדבר תלוי בגורמים רבים. למרות זאת, עדיין משכנתא לנכס מסחרי נחשבת למימון זול יותר על פני אלטרנטיביות אחרות, הרי לבנק יש בטוחה והוא הנכס המשועבד. 

מבחינת מסלולים, גם במקרה זה קיימת תחרות בשוק, ולכן כל בנק  מציע מסלולים שונים כמו מסלול בריבית קבועה או משתנה, מסלולים צמודים למדד ועוד. אולם, דווקא בנדל"ן מסחרי המסלול הפופולרי הוא מסלול בריבית קבועה, אך ניתן גם לשלב בין כמה מסלולים לדוגמה עם ריבות קבועה ועם הרכב גבוה למסלול הריבית הקבועה על מנת לבנות תמהיל טוב יותר.